Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 MSH6YDR097C 3729 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1A-BLQ12266 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-BLQ12266 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-BLQ12266 snR38snR38 95 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1A-BLQ12266 YOL098CYOL098C 3114 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1A-BLQ12266 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1A-BLQ12266 DNF1YER166W 4716 nt2.09□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 AI1Q0050 2505 nt2.09□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 snR70snR70 164 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 PDR11YIL013C 4236 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 SCD5YOR329C 2619 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 KIP1YBL063W 3336 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 EST1YLR233C 2100 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 NAB6YML117W 3405 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 SSD1YDR293C 3753 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 snR14snR14 160 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 PET127YOR017W 2403 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 IRA2YOL081W 9240 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 EMC5YIL027C 426 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 GEA2YEL022W 4380 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 SAC3YDR159W 3906 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1A-BLQ12266 SIR4YDR227W 4077 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 ROM2YLR371W 4071 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 PRP16YKR086W 3216 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 TFC3YAL001C 3483 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 NIP1YMR309C 2439 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 snR69snR69 101 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 YLR419WYLR419W 4308 nt2□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 STH1YIL126W 4080 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 CSF1YLR087C 8877 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 STO1YMR125W 2586 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 PKH3YDR466W 2697 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 SEC16YPL085W 6588 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 SMC4YLR086W 4257 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 SXM1YDR395W 2835 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1A-BLQ12266 SPP41YDR464W 4308 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 RDS3YPR094W 324 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 MYO4YAL029C 4416 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 HER1YOR227W 3741 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 DGR1YNL130C-A 147 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 CSE1YGL238W 2883 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 PET111YMR257C 2403 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 BNI1YNL271C 5862 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 UBR2YLR024C 5619 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 TDA9YML081W 3756 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 KAP122YGL016W 3246 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 SEC8YPR055W 3198 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 UTP22YGR090W 3714 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1A-BLQ12266 INO80YGL150C 4470 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 ULP2YIL031W 3105 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 UBP2YOR124C 3819 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 YSP1YHR155W 3687 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 YLR422WYLR422W 5799 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 APL3YBL037W 3078 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 TOR2YKL203C 7425 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 USO1YDL058W 5373 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 YMR045CYMR045C 5268 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 HUG1YML058W-A 207 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1A-BLQ12266 EST2YLR318W 2655 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 IRC20YLR247C 4671 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 FKS1YLR342W 5631 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 MSH3YCR092C 3057 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 NUP170YBL079W 4509 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 SEC31YDL195W 3822 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 PAU12YGR294W 363 nt1.79□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 SEC3YER008C 4011 nt1.79□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 SKI3YPR189W 4299 nt1.78□□□□□ -2.12
TY1A-BLQ12266 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 NEO1YIL048W 3456 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 SIP4YJL089W 2490 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 NST1YNL091W 3723 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 CDC25YLR310C 4770 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 BUL2YML111W 2763 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 KCS1YDR017C 3153 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 YCS4YLR272C 3531 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 MSN5YDR335W 3675 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 FYV8YGR196C 2454 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1A-BLQ12266 MON2YNL297C 4911 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 SWI4YER111C 3282 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 TMA7YLR262C-A 195 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 PMD1YER132C 5262 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 ATG9YDL149W 2994 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 NUP145YGL092W 3954 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1A-BLQ12266 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.65□□□□□ -2.15
TY1A-BLQ12266 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1A-BLQ12266 NUP188YML103C 4968 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1A-BLQ12266 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1A-BLQ12266 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1A-BLQ12266 CAT8YMR280C 4302 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1A-BLQ12266 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1A-BLQ12266 TRM732YMR259C 4263 nt1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms