Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 CDC25YLR310C 4770 nt2.42□□□□□ -2.02
YRR1Q12172 SCD5YOR329C 2619 nt2.41□□□□□ -2.02
YRR1Q12172 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.4□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 TRA1YHR099W 11235 nt2.4□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.39□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 CSF1YLR087C 8877 nt2.38□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 HER1YOR227W 3741 nt2.38□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 SAC3YDR159W 3906 nt2.37□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 MGA2YIR033W 3342 nt2.35□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 BPH1YCR032W 6504 nt2.35□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 SPF1YEL031W 3648 nt2.35□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 KOG1YHR186C 4674 nt2.35□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 INO80YGL150C 4470 nt2.34□□□□□ -2.03
YRR1Q12172 BEM3YPL115C 3387 nt2.33□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 IRA2YOL081W 9240 nt2.33□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 TFC3YAL001C 3483 nt2.32□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 KAP122YGL016W 3246 nt2.31□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 DNF1YER166W 4716 nt2.31□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 PKH3YDR466W 2697 nt2.31□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 NUP170YBL079W 4509 nt2.3□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 VPS13YLL040C 9435 nt2.3□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 snR14snR14 160 nt2.3□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 STH1YIL126W 4080 nt2.3□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 KCS1YDR017C 3153 nt2.3□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 BRE1YDL074C 2103 nt2.29□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.29□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 STO1YMR125W 2586 nt2.28□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 SEC3YER008C 4011 nt2.28□□□□□ -2.04
YRR1Q12172 SEC8YPR055W 3198 nt2.27□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 YMR045CYMR045C 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.27□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 RPL41AYDL184C 78 nt2.27□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 ULP2YIL031W 3105 nt2.27□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 UTP22YGR090W 3714 nt2.26□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 MYO4YAL029C 4416 nt2.25□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.25□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 EST1YLR233C 2100 nt2.24□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 YSP1YHR155W 3687 nt2.24□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 SKI7YOR076C 2244 nt2.24□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.24□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 SEC31YDL195W 3822 nt2.23□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.23□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.23□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 SKI3YPR189W 4299 nt2.23□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 PRP16YKR086W 3216 nt2.22□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 SMC4YLR086W 4257 nt2.22□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 NST1YNL091W 3723 nt2.21□□□□□ -2.05
YRR1Q12172 snR69snR69 101 nt2.21□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt2.21□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 PET127YOR017W 2403 nt2.21□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 AI1Q0050 2505 nt2.2□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 YOL098CYOL098C 3114 nt2.2□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 ATG9YDL149W 2994 nt2.19□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.19□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 MSN5YDR335W 3675 nt2.19□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 UBR2YLR024C 5619 nt2.18□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 snR38snR38 95 nt2.18□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 BNI1YNL271C 5862 nt2.17□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 IRC20YLR247C 4671 nt2.17□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 UBP2YOR124C 3819 nt2.17□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 YLR419WYLR419W 4308 nt2.17□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.17□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 RDS3YPR094W 324 nt2.17□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.16□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 GEA2YEL022W 4380 nt2.16□□□□□ -2.06
YRR1Q12172 NIP1YMR309C 2439 nt2.15□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.15□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 DGR1YNL130C-A 147 nt2.15□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 APL3YBL037W 3078 nt2.14□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 SXM1YDR395W 2835 nt2.14□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 SEC16YPL085W 6588 nt2.14□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 CSE1YGL238W 2883 nt2.13□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 MSH3YCR092C 3057 nt2.13□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 USO1YDL058W 5373 nt2.11□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 TOR2YKL203C 7425 nt2.11□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 SWI4YER111C 3282 nt2.11□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 SPP41YDR464W 4308 nt2.1□□□□□ -2.07
YRR1Q12172 NUP145YGL092W 3954 nt2.07□□□□□ -2.08
YRR1Q12172 YOR093CYOR093C 4947 nt2.05□□□□□ -2.08
YRR1Q12172 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.04□□□□□ -2.08
YRR1Q12172 HUG1YML058W-A 207 nt2.04□□□□□ -2.08
YRR1Q12172 TMA7YLR262C-A 195 nt2.03□□□□□ -2.08
YRR1Q12172 CLU1YMR012W 3834 nt2□□□□□ -2.09
YRR1Q12172 FKS1YLR342W 5631 nt1.99□□□□□ -2.09
YRR1Q12172 CAT8YMR280C 4302 nt1.98□□□□□ -2.09
YRR1Q12172 SIP4YJL089W 2490 nt1.97□□□□□ -2.09
YRR1Q12172 TRM732YMR259C 4263 nt1.96□□□□□ -2.1
YRR1Q12172 PAU12YGR294W 363 nt1.95□□□□□ -2.1
YRR1Q12172 BUL2YML111W 2763 nt1.94□□□□□ -2.1
YRR1Q12172 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.93□□□□□ -2.1
YRR1Q12172 PMD1YER132C 5262 nt1.93□□□□□ -2.1
YRR1Q12172 NEO1YIL048W 3456 nt1.92□□□□□ -2.1
YRR1Q12172 MON2YNL297C 4911 nt1.89□□□□□ -2.11
YRR1Q12172 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.88□□□□□ -2.11
YRR1Q12172 PET111YMR257C 2403 nt1.88□□□□□ -2.11
YRR1Q12172 EST2YLR318W 2655 nt1.87□□□□□ -2.11
YRR1Q12172 NUP188YML103C 4968 nt1.87□□□□□ -2.11
YRR1Q12172 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.87□□□□□ -2.11
YRR1Q12172 FYV8YGR196C 2454 nt1.85□□□□□ -2.11
YRR1Q12172 BST1YFL025C 3090 nt1.85□□□□□ -2.11
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