Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4CQ08493 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms