Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCN1BQ07699 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms