Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms