Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTBN1Q01082 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms