Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms