Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARF6P62330 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF6P62330 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms