Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms