Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO3P55854 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms