Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV1P50549 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV1P50549 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV1P50549 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV1P50549 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV1P50549 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV1P50549 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV1P50549 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV1P50549 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV1P50549 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms