Protein–RNA interactions for Protein: P40533

TED1, Protein TED1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TED1P40533 WAR1YML076C 2835 nt1.9□□□□□ -2.1
TED1P40533 SEC31YDL195W 3822 nt1.9□□□□□ -2.11
TED1P40533 KCS1YDR017C 3153 nt1.9□□□□□ -2.11
TED1P40533 snR14snR14 160 nt1.89□□□□□ -2.11
TED1P40533 snR53snR53 91 nt1.89□□□□□ -2.11
TED1P40533 CHS1YNL192W 3396 nt1.89□□□□□ -2.11
TED1P40533 FKS1YLR342W 5631 nt1.88□□□□□ -2.11
TED1P40533 TOR2YKL203C 7425 nt1.88□□□□□ -2.11
TED1P40533 MYO4YAL029C 4416 nt1.88□□□□□ -2.11
TED1P40533 UBR2YLR024C 5619 nt1.87□□□□□ -2.11
TED1P40533 CDC25YLR310C 4770 nt1.87□□□□□ -2.11
TED1P40533 KAP122YGL016W 3246 nt1.87□□□□□ -2.11
TED1P40533 SKI3YPR189W 4299 nt1.87□□□□□ -2.11
TED1P40533 TMA7YLR262C-A 195 nt1.86□□□□□ -2.11
TED1P40533 ASE1YOR058C 2658 nt1.86□□□□□ -2.11
TED1P40533 STO1YMR125W 2586 nt1.85□□□□□ -2.11
TED1P40533 ATG9YDL149W 2994 nt1.85□□□□□ -2.11
TED1P40533 SMC4YLR086W 4257 nt1.85□□□□□ -2.11
TED1P40533 SEC10YLR166C 2616 nt1.85□□□□□ -2.11
TED1P40533 YMR045CYMR045C 5268 nt1.84□□□□□ -2.11
TED1P40533 YLR419WYLR419W 4308 nt1.84□□□□□ -2.11
TED1P40533 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.83□□□□□ -2.12
TED1P40533 AZF1YOR113W 2745 nt1.82□□□□□ -2.12
TED1P40533 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.82□□□□□ -2.12
TED1P40533 GLG1YKR058W 1851 nt1.82□□□□□ -2.12
TED1P40533 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.81□□□□□ -2.12
TED1P40533 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.8□□□□□ -2.12
TED1P40533 snR47snR47 99 nt1.8□□□□□ -2.12
TED1P40533 SEC3YER008C 4011 nt1.8□□□□□ -2.12
TED1P40533 NNF2YGR089W 2811 nt1.78□□□□□ -2.12
TED1P40533 UBP3YER151C 2739 nt1.78□□□□□ -2.12
TED1P40533 MGA2YIR033W 3342 nt1.78□□□□□ -2.13
TED1P40533 ORC3YLL004W 1851 nt1.77□□□□□ -2.13
TED1P40533 SAC3YDR159W 3906 nt1.77□□□□□ -2.13
TED1P40533 snR64snR64 101 nt1.77□□□□□ -2.13
TED1P40533 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.77□□□□□ -2.13
TED1P40533 SEC8YPR055W 3198 nt1.76□□□□□ -2.13
TED1P40533 BEM3YPL115C 3387 nt1.76□□□□□ -2.13
TED1P40533 BPH1YCR032W 6504 nt1.75□□□□□ -2.13
TED1P40533 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.74□□□□□ -2.13
TED1P40533 GEA2YEL022W 4380 nt1.74□□□□□ -2.13
TED1P40533 PIK1YNL267W 3201 nt1.74□□□□□ -2.13
TED1P40533 APL3YBL037W 3078 nt1.73□□□□□ -2.13
TED1P40533 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.73□□□□□ -2.13
TED1P40533 YOR093CYOR093C 4947 nt1.73□□□□□ -2.13
TED1P40533 SWI4YER111C 3282 nt1.73□□□□□ -2.13
TED1P40533 PRP16YKR086W 3216 nt1.72□□□□□ -2.13
TED1P40533 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.7□□□□□ -2.14
TED1P40533 YSP1YHR155W 3687 nt1.7□□□□□ -2.14
TED1P40533 FAB1YFR019W 6837 nt1.69□□□□□ -2.14
TED1P40533 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.69□□□□□ -2.14
TED1P40533 ULP2YIL031W 3105 nt1.69□□□□□ -2.14
TED1P40533 NUP145YGL092W 3954 nt1.69□□□□□ -2.14
TED1P40533 ANS1YHR126C 480 nt1.68□□□□□ -2.14
TED1P40533 PKH3YDR466W 2697 nt1.68□□□□□ -2.14
TED1P40533 IRC20YLR247C 4671 nt1.67□□□□□ -2.14
TED1P40533 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.67□□□□□ -2.14
TED1P40533 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.66□□□□□ -2.14
TED1P40533 snR50snR50 90 nt1.66□□□□□ -2.14
TED1P40533 PEP1YBL017C 4740 nt1.65□□□□□ -2.14
TED1P40533 MON2YNL297C 4911 nt1.64□□□□□ -2.15
TED1P40533 MSN5YDR335W 3675 nt1.64□□□□□ -2.15
TED1P40533 TRM732YMR259C 4263 nt1.64□□□□□ -2.15
TED1P40533 DNF3YMR162C 4971 nt1.64□□□□□ -2.15
TED1P40533 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.64□□□□□ -2.15
TED1P40533 FIG2YCR089W 4830 nt1.63□□□□□ -2.15
TED1P40533 IRA1YBR140C 9279 nt1.63□□□□□ -2.15
TED1P40533 CLU1YMR012W 3834 nt1.6□□□□□ -2.15
TED1P40533 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.6□□□□□ -2.15
TED1P40533 EST1YLR233C 2100 nt1.6□□□□□ -2.15
TED1P40533 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.6□□□□□ -2.15
TED1P40533 YKL225WYKL225W 348 nt1.59□□□□□ -2.15
TED1P40533 BST1YFL025C 3090 nt1.58□□□□□ -2.16
TED1P40533 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.58□□□□□ -2.16
TED1P40533 MSH3YCR092C 3057 nt1.58□□□□□ -2.16
TED1P40533 NUP188YML103C 4968 nt1.57□□□□□ -2.16
TED1P40533 snR69snR69 101 nt1.57□□□□□ -2.16
TED1P40533 CFT1YDR301W 4074 nt1.57□□□□□ -2.16
TED1P40533 PMD1YER132C 5262 nt1.56□□□□□ -2.16
TED1P40533 SXM1YDR395W 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
TED1P40533 VPS15YBR097W 4365 nt1.55□□□□□ -2.16
TED1P40533 NST1YNL091W 3723 nt1.55□□□□□ -2.16
TED1P40533 CSE1YGL238W 2883 nt1.54□□□□□ -2.16
TED1P40533 PET127YOR017W 2403 nt1.54□□□□□ -2.16
TED1P40533 RDS3YPR094W 324 nt1.52□□□□□ -2.17
TED1P40533 EST2YLR318W 2655 nt1.51□□□□□ -2.17
TED1P40533 MEC1YBR136W 7107 nt1.5□□□□□ -2.17
TED1P40533 CDC39YCR093W 6327 nt1.5□□□□□ -2.17
TED1P40533 SPC110YDR356W 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
TED1P40533 HUG1YML058W-A 207 nt1.49□□□□□ -2.17
TED1P40533 NUP192YJL039C 5052 nt1.48□□□□□ -2.17
TED1P40533 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.48□□□□□ -2.17
TED1P40533 FYV8YGR196C 2454 nt1.48□□□□□ -2.17
TED1P40533 SSK2YNR031C 4740 nt1.46□□□□□ -2.18
TED1P40533 RPL41AYDL184C 78 nt1.46□□□□□ -2.18
TED1P40533 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.45□□□□□ -2.18
TED1P40533 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.45□□□□□ -2.18
TED1P40533 BRR2YER172C 6492 nt1.44□□□□□ -2.18
TED1P40533 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.43□□□□□ -2.18
TED1P40533 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.4 ms