Protein–RNA interactions for Protein: P38750

YHL008C, Uncharacterized transporter YHL008C, yeastyeast

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CP38750 YML002WYML002W 2214 nt1.98□□□□□ -2.09
YHL008CP38750 YMR045CYMR045C 5268 nt1.97□□□□□ -2.09
YHL008CP38750 CLU1YMR012W 3834 nt1.97□□□□□ -2.09
YHL008CP38750 snR53snR53 91 nt1.97□□□□□ -2.09
YHL008CP38750 RAD9YDR217C 3930 nt1.97□□□□□ -2.09
YHL008CP38750 NEO1YIL048W 3456 nt1.96□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.96□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 YLR232WYLR232W 348 nt1.96□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 SMC4YLR086W 4257 nt1.96□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 NOP9YJL010C 2001 nt1.96□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 RPS26AYGL189C 360 nt1.95□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.95□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.95□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 SEC21YNL287W 2808 nt1.95□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 REV3YPL167C 4515 nt1.95□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 SMC1YFL008W 3678 nt1.93□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 STO1YMR125W 2586 nt1.92□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.91□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 SEC3YER008C 4011 nt1.91□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 PKH3YDR466W 2697 nt1.91□□□□□ -2.1
YHL008CP38750 FYV10YIL097W 1551 nt1.89□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 SWI4YER111C 3282 nt1.89□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 ASE1YOR058C 2658 nt1.88□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 RPL26BYGR034W 384 nt1.87□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 snR190snR190 190 nt1.87□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 GLG1YKR058W 1851 nt1.86□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 snR47snR47 99 nt1.86□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 WAR1YML076C 2835 nt1.86□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 TRM732YMR259C 4263 nt1.86□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 FAB1YFR019W 6837 nt1.86□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 APL3YBL037W 3078 nt1.85□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 IRC20YLR247C 4671 nt1.85□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 BST1YFL025C 3090 nt1.85□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 snR64snR64 101 nt1.84□□□□□ -2.11
YHL008CP38750 MON2YNL297C 4911 nt1.84□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 NUP145YGL092W 3954 nt1.83□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 ORC3YLL004W 1851 nt1.83□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 CHS1YNL192W 3396 nt1.81□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.8□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 BPH1YCR032W 6504 nt1.79□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 ANS1YHR126C 480 nt1.79□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.79□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.78□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 snR50snR50 90 nt1.78□□□□□ -2.12
YHL008CP38750 MSN5YDR335W 3675 nt1.78□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 SEC10YLR166C 2616 nt1.77□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 YDL073WYDL073W 2955 nt1.76□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 EST2YLR318W 2655 nt1.76□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 AZF1YOR113W 2745 nt1.75□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 YOR093CYOR093C 4947 nt1.74□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 PRP16YKR086W 3216 nt1.74□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 SEC8YPR055W 3198 nt1.74□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.73□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 PIK1YNL267W 3201 nt1.73□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 DNF3YMR162C 4971 nt1.72□□□□□ -2.13
YHL008CP38750 UBP3YER151C 2739 nt1.71□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 NUP188YML103C 4968 nt1.71□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 PEP1YBL017C 4740 nt1.71□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 GEA2YEL022W 4380 nt1.7□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 PMD1YER132C 5262 nt1.7□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 NNF2YGR089W 2811 nt1.7□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.69□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 MEC1YBR136W 7107 nt1.68□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 CFT1YDR301W 4074 nt1.67□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.67□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.67□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 IRA1YBR140C 9279 nt1.66□□□□□ -2.14
YHL008CP38750 YKL225WYKL225W 348 nt1.65□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.65□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 BEM3YPL115C 3387 nt1.65□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 CDC39YCR093W 6327 nt1.64□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.63□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 SXM1YDR395W 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 YSP1YHR155W 3687 nt1.61□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.61□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.6□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.59□□□□□ -2.15
YHL008CP38750 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.57□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 ULP2YIL031W 3105 nt1.57□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 SPC110YDR356W 2835 nt1.57□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.56□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 MSH3YCR092C 3057 nt1.56□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.55□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 EST1YLR233C 2100 nt1.55□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 FIG2YCR089W 4830 nt1.54□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 BRR2YER172C 6492 nt1.54□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.53□□□□□ -2.16
YHL008CP38750 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.52□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 snR75snR75 89 nt1.52□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 PET127YOR017W 2403 nt1.51□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 snR69snR69 101 nt1.51□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 CCH1YGR217W 6120 nt1.51□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 NUP192YJL039C 5052 nt1.5□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.49□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 RPL41AYDL184C 78 nt1.49□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.49□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.49□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 CSE1YGL238W 2883 nt1.48□□□□□ -2.17
YHL008CP38750 RDS3YPR094W 324 nt1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.4 ms