Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms