Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRF1P14222 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRF1P14222 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRF1P14222 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRF1P14222 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRF1P14222 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms