Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD28P10747 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD28P10747 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD28P10747 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD28P10747 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD28P10747 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD28P10747 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD28P10747 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD28P10747 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD28P10747 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms