Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms