Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C879 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C879 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C879 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C879 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C879 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C879 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C879 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C879 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C879 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C879 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P0C879 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms