Protein–RNA interactions for Protein: P01569

IFNA5, Interferon alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA5P01569 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFNA5P01569 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNA5P01569 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms