Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLR1AO95602 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR1AO95602 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms