Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRMUO75648 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRMUO75648 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRMUO75648 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRMUO75648 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms