Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SCN2BO60939 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SCN2BO60939 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN2BO60939 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SCN2BO60939 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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