Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBFA2T2O43439 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms