Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRXO43186 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRXO43186 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRXO43186 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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