Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIBO00712 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIBO00712 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIBO00712 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIBO00712 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIBO00712 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIBO00712 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIBO00712 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIBO00712 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIBO00712 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFIBO00712 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFIBO00712 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFIBO00712 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms