Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CENPBD1B2RD01 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPBD1B2RD01 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms