Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NIN4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NIN4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A6NIN4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
A6NIN4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
A6NIN4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A6NIN4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms