Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAV27A0A087WT01 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAV27A0A087WT01 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms