Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01739-204ENST00000641712 1005 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT13-207ENST00000544879 2258 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP20-1Q3LI63 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 S100PBP-202ENST00000373475 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NSUN7-202ENST00000381782 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 COA7-201ENST00000371538 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC091304.1-201ENST00000564897 3034 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 POP4-202ENST00000585603 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF239-201ENST00000306006 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PNPT1-205ENST00000447944 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MSS51-201ENST00000299432 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CA8-201ENST00000317995 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF491-201ENST00000323169 2471 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC3A1-201ENST00000260649 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF530-201ENST00000332854 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC183088.1-201ENST00000626622 3398 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LOXHD1-212ENST00000582408 3755 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SPEF2-201ENST00000282469 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF558-201ENST00000301475 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL161636.1-201ENST00000427145 2254 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ACSM3-202ENST00000440284 1517 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR7E24-201ENST00000456448 1550 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CEP57-202ENST00000325542 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HHAT-207ENST00000541565 3164 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MYO1H-201ENST00000310903 4364 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BBS12-201ENST00000314218 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ERC1-225ENST00000611180 2832 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL360294.1-201ENST00000640945 2438 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms