Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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