Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2J1Q9Y385 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms