Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNND2Q9UQB3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms