Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGA1Q9UJY5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA1Q9UJY5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms