Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL13Q9P2N7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms