Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AIPQ9NXV6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AIPQ9NXV6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms