Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT1Q9NXH9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms