Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLN6Q9NWW5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms