Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BATF3Q9NR55 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms