Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLIRPQ9GZT3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms