Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms