Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM4Q9C037 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM4Q9C037 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms