Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms