Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IFT27Q9BW83 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms