Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF558Q96NG5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms