Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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