Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC124Q96CT7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC124Q96CT7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms