Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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