Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYRIPQ8NFW9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYRIPQ8NFW9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms