Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD4Q8IYR2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms