Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERC6Q8IVU3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC6Q8IVU3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms